上海市第六人民医院始创于1904年，是一家历经百余年积淀的大型三级甲等综合医院。2002年成为上海交通大学附属医院。2021年2月原上海市第六人民医院东院整建制正式并入上海市第六人民医院，开启了两院一体化高质量发展的新征程。2022年成为上海交通大学医学院附属第六人民医院。目前，医院设有徐汇、临港两个院区；核定床位2556张（批复床位3426张），其中徐汇院区1956张（批复床位2226张）、临港院区600张（批复床位1200张）。

医院连续六届19年蝉联“全国文明单位”荣誉称号，连续18年上海市级医院绩效考核全A，是上海市公立医院高质量发展辅导类试点单位。在国家三级公立医院绩效考核中最高排名33名；在中国医院科技量值排行榜中最高排名25名；在复旦大学医院管理研究所发布的最佳医院排行榜中最高排名20名，骨科、内分泌代谢科、耳鼻咽喉头颈外科、超声医学科稳居全国前十位；在医疗机构NATURE指数中最高全球排名第66名；在《中国医院创新转化排行榜》中最高综合排名第12名；荣获上海市医学创新转化指数十强医疗机构、上海市医学创新转化指数综合十强医疗机构；获批上海市科技成果转化创新改革试点单位、上海市科学技术委员会专业化技术转移示范机构、转化医学国家科学中心（上海）上海市第六人民医院分中心。

1958年，周永昌教授等在这里开创了超声医学事业，医院被誉为“中国超声诊断发源地”。1963年，陈中伟教授、钱允庆教授等完成了国际医学史上第一例断肢再植手术，医院被誉为“世界断肢再植的摇篮”。1978年，于仲嘉教授等研究并成功实施“手或全手指缺失的再造技术”，被世界誉为“中国手”的诞生地，荣获国家发明一等奖。1980年，陈中伟教授因在骨科断肢再植领域的卓越贡献当选为中国科学院院士。2003年，项坤三教授因在糖尿病遗传学领域的卓越贡献当选为中国工程院院士。2020年贾伟平教授因在糖尿病防治领域的杰出成就当选为中国医学科学院学部委员、2021年当选为中国工程院院士、2023年当选为发展中国家科学院院士。2023年贾伟教授因在代谢生理学和转化医学领域的杰出贡献当选欧洲科学院生理学与神经科学学部院士。医院拥有国家973首席科学家2名、卫生部/人社部突出贡献中青年专家7名、国家自然基金委杰出青年基金项目获得者6名。

2022年医院获批国家骨科医学中心。医院是上海市急性创伤急救中心、上海市危重孕产妇会诊抢救中心、上海市脑卒中临床救治中心和上海市传染病专科诊治中心挂牌单位，是中华全国体育总会中国国家队合作医院。是上海交通大学博士学位研究生及博士后培养基地，现有博士研究生导师138名、硕士研究生导师179名。医学教育教学成果丰富，曾获国家教学成果二等奖和上海市教学成果奖一等奖。

医院现有国家临床重点专科9个，国家重点学科3个，国家中医药管理局重点专科1个，是全国综合医院中医药工作示范单位、上海市中西医结合旗舰医院。设有国家基层糖尿病防治办公室，上海市糖尿病重点实验室、睡眠呼吸障碍疾病重点实验室、神经超声影像诊疗重点实验室、骨科新材料与修复再生工程技术研究中心、神经系统罕见疾病生物样本库和精准诊断专业技术服务平台、四肢显微外科研究所、糖尿病研究所等研究平台。